289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2794 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  313  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 
156 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 
156 aa  147  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  49.36 
 
 
155 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  50.32 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 
155 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  44.03 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  45.96 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
160 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  43.79 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  44.87 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  42.53 
 
 
174 aa  127  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  123  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 
164 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
160 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 
162 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  44.87 
 
 
140 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
160 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
160 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
185 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 
160 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  44.38 
 
 
152 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  42.95 
 
 
141 aa  113  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  41.03 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  43.8 
 
 
137 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  36.94 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  39.88 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  36.94 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  41.18 
 
 
156 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  38.75 
 
 
156 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  35.58 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  48.51 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  47.52 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  29.76 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  29.76 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  36.94 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  40.38 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 
156 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  46.53 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  30.72 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  36.18 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  32.73 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  33.75 
 
 
154 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  31.52 
 
 
159 aa  87  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  36.71 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  35.58 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  47.42 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  34.97 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  29.76 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  27.98 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  34.36 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  39.35 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  41.6 
 
 
173 aa  84.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  42.16 
 
 
157 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  35.58 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  32.12 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  46.24 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  33.76 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  35.26 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  45.92 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  40.19 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  39.64 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  32.9 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>