More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2771 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 686 aa  1368    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  33.17 
 
 		 681 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  41.8 
 
 		 797 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  30.69 
 
 		 780 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  42.02 
 
 		 794 aa  249  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  30.36 
 
 		 733 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  29.64 
 
 		 751 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.19 
 
 		 745 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  27.95 
 
 		 775 aa  223  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  27.95 
 
 		 775 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  26.78 
 
 		 720 aa  210  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  40.64 
 
 		 756 aa  200  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  38.21 
 
 		 829 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  27.78 
 
 		 752 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  37.5 
 
 		 784 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  25.81 
 
 		 641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  38.08 
 
 		 819 aa  184  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  37.04 
 
 		 779 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  37.42 
 
 		 767 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  26.3 
 
 		 803 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  34.58 
 
 		 833 aa  180  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  38.06 
 
 		 773 aa  180  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  26.31 
 
 		 635 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  35.45 
 
 		 751 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  35.79 
 
 		 763 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  26.48 
 
 		 711 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  24.88 
 
 		 696 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  34.03 
 
 		 801 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  39.07 
 
 		 774 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  34.56 
 
 		 776 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  33.11 
 
 		 793 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 799 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  36.02 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  38.08 
 
 		 805 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.42 
 
 		 636 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  25.44 
 
 		 630 aa  161  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  25.41 
 
 		 632 aa  161  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  25.38 
 
 		 640 aa  159  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  25.38 
 
 		 640 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  32.69 
 
 		 766 aa  158  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  25.21 
 
 		 640 aa  157  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  26.1 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  26.85 
 
 		 705 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  27.02 
 
 		 705 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  25.86 
 
 		 703 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 689 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.4 
 
 		 704 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 650 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 654 aa  152  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  26.46 
 
 		 654 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  26.91 
 
 		 681 aa  150  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 662 aa  150  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  28 
 
 		 740 aa  150  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  27.64 
 
 		 640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  26.15 
 
 		 710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  26.15 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 781 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  26.81 
 
 		 702 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.4 
 
 		 704 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  25.77 
 
 		 750 aa  148  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  27.06 
 
 		 700 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  27.06 
 
 		 700 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.33 
 
 		 787 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.5 
 
 		 717 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  33.44 
 
 		 714 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  25.99 
 
 		 705 aa  147  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.18 
 
 		 697 aa  147  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  30.28 
 
 		 655 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  26.55 
 
 		 714 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  25.58 
 
 		 660 aa  147  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  25.04 
 
 		 757 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  26.37 
 
 		 710 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  31.99 
 
 		 716 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 750 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  26.9 
 
 		 703 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 757 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 696 aa  145  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  28.45 
 
 		 781 aa  145  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 757 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 757 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 757 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  24.74 
 
 		 757 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  27.57 
 
 		 640 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  31.31 
 
 		 744 aa  144  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.35 
 
 		 738 aa  144  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  25.55 
 
 		 728 aa  144  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 		 648 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  25.91 
 
 		 702 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  26.71 
 
 		 724 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  26.68 
 
 		 650 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  26.19 
 
 		 707 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  27.73 
 
 		 776 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  24.88 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  31.75 
 
 		 810 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  25.15 
 
 		 807 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  24.77 
 
 		 783 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  27.11 
 
 		 758 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  24.78 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  29.19 
 
 		 753 aa  136  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  24.88 
 
 		 672 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>