More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2739 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  55.97 
 
 
600 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
622 aa  1281    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  53.26 
 
 
614 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  49.26 
 
 
609 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  43.17 
 
 
599 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  43.66 
 
 
1017 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  44.16 
 
 
1942 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  46.27 
 
 
925 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  42.39 
 
 
604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  43.59 
 
 
1005 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.11 
 
 
1891 aa  465  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  42.49 
 
 
593 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.59 
 
 
1855 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  47.45 
 
 
1975 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  40.76 
 
 
723 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.46 
 
 
2068 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  30.72 
 
 
885 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  31.31 
 
 
838 aa  208  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 
836 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  29.89 
 
 
814 aa  172  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  30.34 
 
 
655 aa  163  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  28.72 
 
 
617 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.46 
 
 
610 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 
653 aa  156  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 
650 aa  154  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  29 
 
 
659 aa  153  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  27.44 
 
 
686 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  28.55 
 
 
617 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  28.63 
 
 
686 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  27.86 
 
 
619 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 
624 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.02 
 
 
694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.07 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.56 
 
 
571 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  26.02 
 
 
762 aa  140  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  26.32 
 
 
690 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  28.32 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 
646 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  29.05 
 
 
687 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  28.57 
 
 
687 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  29.05 
 
 
687 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  30.63 
 
 
687 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  26.52 
 
 
630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  39.39 
 
 
620 aa  124  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  25.77 
 
 
609 aa  124  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  41.36 
 
 
511 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  46.38 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  25.75 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 
878 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  23.65 
 
 
739 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  26.76 
 
 
676 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 
521 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 
561 aa  122  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  25.73 
 
 
572 aa  120  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 
654 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.75 
 
 
553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  24.14 
 
 
639 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  25.57 
 
 
552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  27.16 
 
 
527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  44.53 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 
509 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  43.8 
 
 
533 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 
619 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  26.52 
 
 
566 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 
853 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 
878 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 
878 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  24.04 
 
 
623 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  35.29 
 
 
1021 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  25.85 
 
 
675 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  30.66 
 
 
997 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  40 
 
 
2638 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 
583 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  23.93 
 
 
1401 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  38.56 
 
 
484 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  42.96 
 
 
688 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  40.54 
 
 
676 aa  110  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 
631 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  24.47 
 
 
644 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  42.54 
 
 
676 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  42.54 
 
 
676 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  42.54 
 
 
676 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  42.54 
 
 
676 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 
1643 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  23.97 
 
 
576 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  42.54 
 
 
676 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  40.62 
 
 
752 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  42.54 
 
 
676 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  42.54 
 
 
676 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  23.64 
 
 
586 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  26.27 
 
 
675 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  26.27 
 
 
675 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  26.4 
 
 
675 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  24.56 
 
 
584 aa  107  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  26.44 
 
 
555 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27.01 
 
 
522 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  26.44 
 
 
555 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.19 
 
 
559 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>