48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2722 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2722  tryptophan halogenase  100 
 
 
426 aa  865    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0792075  decreased coverage  0.00766625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  23.9 
 
 
510 aa  86.7  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  24.06 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  21.84 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  20.87 
 
 
503 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  20.67 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  20.67 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  20.67 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  20.75 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  20.69 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  22.43 
 
 
497 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  21.4 
 
 
505 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  24.42 
 
 
506 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  24.71 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  22.99 
 
 
507 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  18.86 
 
 
494 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  22.57 
 
 
501 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  22.36 
 
 
501 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  28 
 
 
497 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  24.71 
 
 
500 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  25.84 
 
 
506 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  19.51 
 
 
499 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  21.18 
 
 
496 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  19.72 
 
 
499 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  22.09 
 
 
500 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  21.3 
 
 
496 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  23.26 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  31.51 
 
 
518 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  21.13 
 
 
503 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  20.97 
 
 
740 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  27.97 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  20.71 
 
 
498 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  18.94 
 
 
504 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  20 
 
 
498 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  22.09 
 
 
499 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  22.16 
 
 
523 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  27.63 
 
 
501 aa  50.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  21.71 
 
 
504 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  24.14 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  20 
 
 
510 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  24.14 
 
 
505 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  24.82 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  18.34 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  22.22 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  24.18 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  22.49 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  26.95 
 
 
515 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  21.02 
 
 
511 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>