51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2696 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  100 
 
 
2194 aa  4297    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  45.7 
 
 
1359 aa  914    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  35.37 
 
 
2886 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.36 
 
 
4480 aa  289  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  30.76 
 
 
1699 aa  263  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.16 
 
 
5442 aa  222  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  34.81 
 
 
1902 aa  207  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.26 
 
 
2156 aa  179  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  30.91 
 
 
1895 aa  170  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  26.37 
 
 
3864 aa  140  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  36.98 
 
 
852 aa  135  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 
3066 aa  135  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  26.55 
 
 
7434 aa  132  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  26.55 
 
 
4830 aa  130  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  28.94 
 
 
1184 aa  127  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.54 
 
 
1879 aa  119  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  31.95 
 
 
2233 aa  115  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  43.75 
 
 
3391 aa  99.4  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  28.02 
 
 
1196 aa  90.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  35.1 
 
 
1092 aa  87.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.05 
 
 
2839 aa  85.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.02 
 
 
3227 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  35.29 
 
 
2802 aa  80.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  32.13 
 
 
954 aa  73.2  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  30.32 
 
 
860 aa  72.8  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  34.68 
 
 
4697 aa  72  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  27.26 
 
 
918 aa  70.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  30 
 
 
2768 aa  65.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  29.66 
 
 
3089 aa  64.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  30.96 
 
 
781 aa  62.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  30.98 
 
 
873 aa  60.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  28.47 
 
 
846 aa  60.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  32.8 
 
 
819 aa  60.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  26.51 
 
 
790 aa  58.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  33.82 
 
 
1151 aa  57.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1799  hypothetical protein  42.55 
 
 
562 aa  56.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  27.33 
 
 
763 aa  55.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  34.34 
 
 
3562 aa  55.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  29.05 
 
 
777 aa  55.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  32.81 
 
 
768 aa  54.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  36.96 
 
 
1526 aa  53.5  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  27.27 
 
 
1695 aa  51.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  26.48 
 
 
2503 aa  50.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3786  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 
573 aa  50.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  24.54 
 
 
989 aa  50.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  25.3 
 
 
3699 aa  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  28.2 
 
 
3544 aa  47.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  28.37 
 
 
2522 aa  47.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  27.6 
 
 
764 aa  46.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  25.65 
 
 
3340 aa  46.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  32.81 
 
 
770 aa  46.2  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>