280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2612 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 349 aa  678    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  25 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  23.58 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.42 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  22.04 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  26.44 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 385 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  38 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  27.05 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  37.11 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  36.08 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  27.78 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  22.27 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  17.48 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.26 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  36.17 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  31.96 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  32.29 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.88 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 292 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>