38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2587 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  100 
 
 
252 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  47.35 
 
 
257 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  47.35 
 
 
257 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  54.31 
 
 
262 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  49.6 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  49.6 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  49.6 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  51.82 
 
 
252 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  51.44 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  49.17 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  49.59 
 
 
266 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  47.35 
 
 
279 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  45.45 
 
 
245 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  43.51 
 
 
248 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  47.7 
 
 
242 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  27.82 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  32 
 
 
193 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  29.67 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  26.61 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  28.87 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  27.88 
 
 
203 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  28.28 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  26.47 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  30.1 
 
 
213 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.09 
 
 
197 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.89 
 
 
198 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
218 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
218 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  34.29 
 
 
186 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.8 
 
 
213 aa  45.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.8 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4657  hypothetical protein  27.67 
 
 
365 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.774318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.18 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  32.89 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  28.48 
 
 
166 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  35.44 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  34.48 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>