More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2514 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  100 
 
 
632 aa  1268    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 
682 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 
613 aa  243  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
640 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
627 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 
662 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 
673 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
618 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 
634 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 
642 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 
656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 
655 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 
695 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  27.92 
 
 
671 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  31.09 
 
 
611 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 
611 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
692 aa  193  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
641 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 
635 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
690 aa  191  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.31 
 
 
646 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 
634 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 
659 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.88 
 
 
638 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
613 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
645 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
680 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 
623 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.28 
 
 
638 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 
714 aa  161  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
625 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 
634 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 
615 aa  153  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.4 
 
 
631 aa  150  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.58 
 
 
619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
626 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
626 aa  144  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
647 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
614 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.05 
 
 
614 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.05 
 
 
614 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.05 
 
 
614 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.05 
 
 
614 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.9 
 
 
614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 
617 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.03 
 
 
614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.03 
 
 
614 aa  135  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.27 
 
 
1023 aa  134  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.61 
 
 
616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.37 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
624 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.94 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
637 aa  128  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 
617 aa  127  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 
627 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
627 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.84 
 
 
613 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.76 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 
602 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.11 
 
 
616 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
624 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 
628 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 
612 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
638 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  25.19 
 
 
631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.69 
 
 
631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  23.26 
 
 
611 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
619 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
611 aa  112  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.38 
 
 
631 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
620 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.08 
 
 
620 aa  108  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.8 
 
 
618 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  24.37 
 
 
639 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.56 
 
 
821 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.4 
 
 
685 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.4 
 
 
685 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
737 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.4 
 
 
685 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
697 aa  104  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.56 
 
 
685 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.79 
 
 
661 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  25.4 
 
 
685 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.4 
 
 
685 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 
627 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  25.23 
 
 
680 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 
670 aa  101  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
651 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  23.17 
 
 
617 aa  100  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
641 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 
624 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  24.72 
 
 
623 aa  99  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 
648 aa  97.8  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
627 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  25.57 
 
 
621 aa  95.1  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>