45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2478 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 379 aa  784    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 		 545 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 856 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 867 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.2 
 
 		 1644 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.2 
 
 		 1644 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  32 
 
 		 787 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 873 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 725 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 3301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 774 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 671 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  28.95 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 791 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  30.17 
 
 		 916 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 1044 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 1386 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.13 
 
 		 1219 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1232 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 679 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 1233 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  52.27 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 743 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>