More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2437 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2437  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 
352 aa  716    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  62.68 
 
 
1271 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  61.58 
 
 
358 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  61.45 
 
 
1247 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  56.52 
 
 
1238 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  55.59 
 
 
1246 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  57.14 
 
 
1286 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  58.33 
 
 
1241 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  56.66 
 
 
1293 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  58.26 
 
 
1257 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  56.01 
 
 
1226 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  58.21 
 
 
1245 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  57.71 
 
 
1234 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  55.98 
 
 
1240 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  58.79 
 
 
1264 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  55.18 
 
 
1244 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  57.71 
 
 
1234 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  54.62 
 
 
1244 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  57.91 
 
 
1263 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  55.9 
 
 
1244 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  55.62 
 
 
1244 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  57.71 
 
 
1278 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  57.69 
 
 
1251 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  56.29 
 
 
1235 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  58.38 
 
 
1257 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3617  methionine synthase (B12-dependent)  59.76 
 
 
349 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732066  normal  0.0126884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  56.57 
 
 
1235 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  55.34 
 
 
1244 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  55.34 
 
 
1244 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  54.62 
 
 
1244 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  58.09 
 
 
1245 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  58.09 
 
 
1257 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  56.93 
 
 
1233 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  58.89 
 
 
1250 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  56.57 
 
 
1235 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  55.17 
 
 
1230 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  59.71 
 
 
1261 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  54.86 
 
 
1244 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  56 
 
 
1239 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  59.18 
 
 
1250 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  56 
 
 
1239 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  59.18 
 
 
1250 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  57.97 
 
 
1250 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  59.59 
 
 
1250 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  56.57 
 
 
1235 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  59.71 
 
 
1261 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  60.58 
 
 
1248 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  56.73 
 
 
1304 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  54.89 
 
 
1245 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  59.65 
 
 
1287 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  56.86 
 
 
1236 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  57.02 
 
 
1290 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  56 
 
 
1236 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  55.3 
 
 
1232 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  56.98 
 
 
1246 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  52.84 
 
 
1245 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3347  methionine synthase (B12-dependent)  60.42 
 
 
359 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  57.88 
 
 
372 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  53.94 
 
 
1226 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  58.48 
 
 
1293 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  55.43 
 
 
353 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  55.78 
 
 
1252 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2998  methionine synthase  60.67 
 
 
359 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639431  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  57.43 
 
 
1250 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  54.3 
 
 
1226 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  57.97 
 
 
1263 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  56.72 
 
 
1228 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  56.68 
 
 
1272 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  58.48 
 
 
356 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  57.78 
 
 
355 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  57.36 
 
 
355 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  57.96 
 
 
355 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  57.36 
 
 
355 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  57.36 
 
 
355 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3384  B12-dependent methionine synthase  57.01 
 
 
1210 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  57.49 
 
 
339 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  57.1 
 
 
356 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  56.38 
 
 
1228 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  54.44 
 
 
1232 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  57.49 
 
 
367 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  53.28 
 
 
1239 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  54.44 
 
 
358 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  56.89 
 
 
355 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0172  methionine synthase (B12-dependent)  58.43 
 
 
348 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.727422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  58.36 
 
 
359 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  58.02 
 
 
1269 aa  371  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 
1226 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  60.62 
 
 
342 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  54.02 
 
 
1227 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  56.76 
 
 
346 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.18 
 
 
359 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.18 
 
 
359 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.18 
 
 
359 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  58.68 
 
 
1257 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  58.18 
 
 
359 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  57.36 
 
 
346 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  57.88 
 
 
358 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  56.65 
 
 
1238 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.18 
 
 
359 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.18 
 
 
359 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>