More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2365 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  100 
 
 
470 aa  939    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  30.25 
 
 
478 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  30.41 
 
 
440 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  27.73 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  29.24 
 
 
426 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  27.29 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.03 
 
 
411 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  31.08 
 
 
686 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  32.92 
 
 
666 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  27.2 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  27.47 
 
 
543 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  31.83 
 
 
702 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.43 
 
 
407 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  30.16 
 
 
433 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  26.6 
 
 
694 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.08 
 
 
680 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  30.13 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  28.84 
 
 
692 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.46 
 
 
426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.19 
 
 
426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.95 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.01 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.15 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.69 
 
 
418 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  29.42 
 
 
496 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.59 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  26.81 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  28.7 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.7 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.82 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.49 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  34.04 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.04 
 
 
391 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.73 
 
 
431 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.37 
 
 
432 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  26 
 
 
540 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  29.28 
 
 
444 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.29 
 
 
433 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  27.29 
 
 
416 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  30.4 
 
 
425 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.74 
 
 
438 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.86 
 
 
433 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.73 
 
 
409 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  28.96 
 
 
413 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  26.59 
 
 
1052 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  28.48 
 
 
480 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.86 
 
 
391 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.92 
 
 
415 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  25.58 
 
 
568 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.51 
 
 
409 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.51 
 
 
409 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  30.93 
 
 
417 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  33.42 
 
 
351 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  26.42 
 
 
444 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.73 
 
 
485 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  26.08 
 
 
411 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.36 
 
 
426 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  25.45 
 
 
585 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.73 
 
 
672 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  27.57 
 
 
413 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  26.9 
 
 
490 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  27.85 
 
 
412 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  27.56 
 
 
415 aa  100  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  28.48 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.29 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  27.13 
 
 
445 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  27.53 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  25.5 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.83 
 
 
437 aa  97.8  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  27.56 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.8 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  27.09 
 
 
1062 aa  97.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.73 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  33.33 
 
 
381 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  27.97 
 
 
511 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  23.97 
 
 
412 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  27.59 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.2 
 
 
1014 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  26.91 
 
 
407 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  25.54 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.51 
 
 
431 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.32 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  25.39 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.32 
 
 
413 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.83 
 
 
434 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.44 
 
 
432 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.23 
 
 
414 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  25.32 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  27.58 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.83 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.85 
 
 
426 aa  93.2  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  27.14 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.94 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.64 
 
 
413 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  27.55 
 
 
436 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  27.34 
 
 
1078 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  26.18 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  23.53 
 
 
412 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  28.41 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.83 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>