More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2337 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  35.69 
 
 
1047 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  41.91 
 
 
1034 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  36.95 
 
 
1045 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  42.64 
 
 
1034 aa  781    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  41.63 
 
 
1053 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  42.29 
 
 
1048 aa  754    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  38.45 
 
 
1021 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  42.82 
 
 
1032 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  42.63 
 
 
1033 aa  784    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  38.38 
 
 
1066 aa  676    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  37.27 
 
 
1032 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  41.7 
 
 
1016 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  42.22 
 
 
1049 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.25 
 
 
1038 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  41.51 
 
 
1064 aa  756    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  41.84 
 
 
1070 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  40.99 
 
 
1038 aa  740    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  43.71 
 
 
1066 aa  822    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  42.58 
 
 
1075 aa  777    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  41.68 
 
 
1053 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  41.26 
 
 
1077 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  41.21 
 
 
1049 aa  783    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  40.84 
 
 
1052 aa  785    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  40.91 
 
 
1054 aa  755    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  43.15 
 
 
1036 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 
1033 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  36.35 
 
 
1029 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  43.88 
 
 
1032 aa  804    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  36.76 
 
 
1051 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  35.34 
 
 
1044 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  43.64 
 
 
1032 aa  792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  41.5 
 
 
1028 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  42.51 
 
 
1038 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  42.13 
 
 
1075 aa  784    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  40.5 
 
 
1037 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  37.49 
 
 
1056 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  42.33 
 
 
1059 aa  770    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  41.15 
 
 
1066 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  39.74 
 
 
1038 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  41.45 
 
 
1077 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  43.49 
 
 
1045 aa  756    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  38.93 
 
 
1047 aa  729    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  40.68 
 
 
1062 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  36.45 
 
 
1017 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  59.67 
 
 
1035 aa  1174    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  41.44 
 
 
1050 aa  782    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  41.54 
 
 
1045 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  41.64 
 
 
1070 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  36.19 
 
 
1045 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  42.01 
 
 
1034 aa  769    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  38.67 
 
 
1028 aa  701    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  44.1 
 
 
1065 aa  843    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  43.02 
 
 
1064 aa  815    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  37.86 
 
 
1037 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 
1021 aa  692    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  40.93 
 
 
1040 aa  743    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  35.62 
 
 
1059 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 
1019 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  40.23 
 
 
1058 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  41.93 
 
 
1077 aa  767    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  41.79 
 
 
1022 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  36.73 
 
 
1051 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  40.94 
 
 
1026 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  38.33 
 
 
1083 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  36.93 
 
 
1043 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  41.95 
 
 
1070 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  40.62 
 
 
1043 aa  751    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  38.76 
 
 
1038 aa  719    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  35.99 
 
 
1052 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  42.65 
 
 
1031 aa  766    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  37.57 
 
 
1029 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  40.2 
 
 
1040 aa  741    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  41.79 
 
 
1046 aa  752    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  35.32 
 
 
1032 aa  647    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  41.81 
 
 
1083 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  41.79 
 
 
1077 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  40.88 
 
 
1070 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  37.19 
 
 
1043 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  41.01 
 
 
1070 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  40.46 
 
 
1056 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  40.12 
 
 
1026 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  36.2 
 
 
1060 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  36.78 
 
 
1065 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  40.88 
 
 
1069 aa  756    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  41.35 
 
 
1072 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  36.59 
 
 
1060 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  37.68 
 
 
1079 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  41.62 
 
 
1063 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  38.52 
 
 
1455 aa  745    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  43.01 
 
 
1062 aa  785    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  42.32 
 
 
1023 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  41.78 
 
 
1043 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.55 
 
 
1456 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  37.3 
 
 
1058 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  37 
 
 
1017 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  41.95 
 
 
1070 aa  774    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  36.45 
 
 
1017 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1046 aa  2074    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  41.84 
 
 
1070 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 
1037 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>