More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2325 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
172 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  51.97 
 
 
141 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  48.82 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
151 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 
133 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
137 aa  114  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  44.72 
 
 
133 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
147 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  41.27 
 
 
137 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  42.07 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.6 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  37.98 
 
 
135 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 
132 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.55 
 
 
154 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.41 
 
 
128 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
162 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
138 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
136 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
136 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
140 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 
135 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
149 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  39.55 
 
 
142 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
149 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
154 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
132 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
132 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
152 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.76 
 
 
132 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
130 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
147 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 
151 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  37.01 
 
 
134 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
142 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  38.28 
 
 
138 aa  103  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  40.8 
 
 
132 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
129 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 
154 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.54 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
146 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.69 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
140 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
131 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  40.77 
 
 
141 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  39.1 
 
 
147 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
129 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
142 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  39.06 
 
 
131 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  40.48 
 
 
135 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
149 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
141 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.8 
 
 
144 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
134 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 
131 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
137 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
150 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
129 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  40.62 
 
 
132 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  37.9 
 
 
130 aa  100  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
134 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
134 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4622  transcriptional regulator, MerR family  36.64 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
128 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 
158 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
137 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 
158 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2562  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>