222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2223 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  51.58 
 
 
205 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  52.72 
 
 
192 aa  188  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  51.31 
 
 
218 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  49.74 
 
 
217 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  50.52 
 
 
237 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  49.46 
 
 
199 aa  184  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  51.35 
 
 
219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  48.42 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  49.74 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  47.67 
 
 
202 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  47.67 
 
 
202 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  48.19 
 
 
202 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  47.24 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  46.04 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  47.67 
 
 
221 aa  178  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  48.95 
 
 
213 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  48.21 
 
 
206 aa  178  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  48.95 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  44.16 
 
 
197 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  45.6 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  45.05 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  49.18 
 
 
192 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  46.84 
 
 
206 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  46.88 
 
 
205 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  45.59 
 
 
213 aa  168  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  45.11 
 
 
190 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 
203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  42.02 
 
 
189 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  40.96 
 
 
200 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  42.64 
 
 
216 aa  158  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  40.96 
 
 
187 aa  157  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  44.26 
 
 
192 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  45.05 
 
 
186 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  41.79 
 
 
200 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  41.79 
 
 
200 aa  154  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  40.32 
 
 
212 aa  154  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  41.81 
 
 
174 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  40.62 
 
 
191 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  42.49 
 
 
214 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  38.58 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  39.68 
 
 
211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  39.68 
 
 
211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  151  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  151  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  151  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  151  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  41.84 
 
 
200 aa  150  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  42.08 
 
 
186 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  40.53 
 
 
201 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  41.97 
 
 
201 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  43.39 
 
 
202 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  41.15 
 
 
201 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  38.69 
 
 
197 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  40.43 
 
 
187 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  40.43 
 
 
187 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  40.96 
 
 
186 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  40.43 
 
 
187 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  40.76 
 
 
188 aa  148  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  40.96 
 
 
200 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  40.96 
 
 
200 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  40.96 
 
 
187 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  41.4 
 
 
186 aa  147  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  40.96 
 
 
187 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  40.32 
 
 
187 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  41.76 
 
 
185 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  40.32 
 
 
208 aa  147  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  40.96 
 
 
187 aa  147  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  40.43 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  40.96 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  39.41 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  40.86 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  37.16 
 
 
187 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  42.78 
 
 
191 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  40.32 
 
 
189 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  39.78 
 
 
187 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  40.11 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  39.68 
 
 
187 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  37.16 
 
 
187 aa  144  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  38.83 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  39.89 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  38.83 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  38.83 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  40.96 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  39.13 
 
 
187 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  42.25 
 
 
193 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1827  hypothetical protein  40.44 
 
 
188 aa  143  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  40.22 
 
 
214 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  39.36 
 
 
192 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  39.36 
 
 
192 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  41.44 
 
 
188 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  39.36 
 
 
192 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  39.36 
 
 
192 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  39.15 
 
 
187 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>