More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2108 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.13 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  25.68 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  40.26 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  34.06 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.28 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  33.98 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2538  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>