146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2002 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  37.22 
 
 
312 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  33.12 
 
 
312 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  33.12 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  31.25 
 
 
312 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  32.14 
 
 
312 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  33.01 
 
 
312 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  33.01 
 
 
312 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.97 
 
 
313 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  32.26 
 
 
312 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  31.13 
 
 
308 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  30.82 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  32.71 
 
 
313 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  29.43 
 
 
302 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  32.08 
 
 
308 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  31.37 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  31.35 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  30.55 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  33.23 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  30.63 
 
 
308 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  35.69 
 
 
433 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  35.27 
 
 
579 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  29.45 
 
 
321 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.05 
 
 
321 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  30.84 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  28.83 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  26.61 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.3 
 
 
331 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  36.84 
 
 
360 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  26.97 
 
 
331 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  30.1 
 
 
313 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  29.9 
 
 
307 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  28.85 
 
 
353 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  36.13 
 
 
359 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.08 
 
 
307 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  35.08 
 
 
359 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  34.63 
 
 
378 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  31.86 
 
 
360 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  31.86 
 
 
360 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  27.56 
 
 
307 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  31.86 
 
 
360 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.8 
 
 
296 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.36 
 
 
296 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.91 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  30.86 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  30.15 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.12 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.16 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.05 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.65 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  24.04 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.04 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  27.34 
 
 
289 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  37.57 
 
 
369 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  25.41 
 
 
288 aa  94  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  27.34 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  26.3 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  30.28 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  35.08 
 
 
367 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  31.47 
 
 
458 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  29.67 
 
 
455 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  26.81 
 
 
310 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  30.46 
 
 
456 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  26.81 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  29.95 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  33.19 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  33.19 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  28.22 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  34.47 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  24.18 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  26.25 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  31.13 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  44.83 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  25.86 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  23.44 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  43.1 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  21.81 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  28.28 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  43.97 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  25.62 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  23.81 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.61 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  24.76 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  28.09 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  29.57 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  27.78 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  22.3 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  27.57 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  23.74 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  24.9 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  27.37 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.18 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  29.49 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  27.81 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  23.68 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  26.28 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.79 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>