More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1929 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
853 aa  1713    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
840 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.43 
 
 
695 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.37 
 
 
892 aa  436  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  34.73 
 
 
945 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  34.62 
 
 
945 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
857 aa  422  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  34.95 
 
 
866 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
847 aa  419  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
853 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
888 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
880 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
853 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
874 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
867 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.71 
 
 
803 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  34.94 
 
 
872 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  34.97 
 
 
903 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
850 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
925 aa  393  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
872 aa  393  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
867 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
903 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
906 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
752 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.64 
 
 
857 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  31.16 
 
 
845 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.87 
 
 
839 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.25 
 
 
793 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
811 aa  366  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
890 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
869 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
766 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
770 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  38.92 
 
 
829 aa  355  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.42 
 
 
766 aa  354  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
769 aa  350  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 
680 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.46 
 
 
824 aa  341  4e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  39.77 
 
 
828 aa  337  7.999999999999999e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  42.27 
 
 
417 aa  330  7e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  46.76 
 
 
779 aa  324  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
1018 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 
751 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  42.29 
 
 
749 aa  293  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
650 aa  293  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1132 aa  290  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  39.88 
 
 
733 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
661 aa  286  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
639 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  40.56 
 
 
824 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1260 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
522 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
819 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
769 aa  277  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
1260 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
557 aa  273  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
1079 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
758 aa  273  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
859 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
743 aa  272  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
853 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
983 aa  271  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
953 aa  271  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.63 
 
 
637 aa  269  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
1106 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
766 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.11 
 
 
1112 aa  268  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
849 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
673 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
655 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
551 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
831 aa  265  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1054 aa  264  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 
641 aa  264  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
711 aa  263  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
845 aa  263  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  39.55 
 
 
1561 aa  263  8.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
922 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  38.24 
 
 
1015 aa  260  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  33.75 
 
 
742 aa  260  6e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
807 aa  260  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1134 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
962 aa  259  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
926 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
773 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
845 aa  257  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  38.48 
 
 
594 aa  257  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1176 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
692 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
1102 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
1021 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
740 aa  255  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  41.03 
 
 
571 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.34 
 
 
844 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1215 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
773 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
798 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
798 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>