More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1900 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
113 aa  224  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  54.12 
 
 
110 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  48.11 
 
 
143 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  46.81 
 
 
104 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  52.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  55.81 
 
 
93 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  57.14 
 
 
94 aa  99.4  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  52.27 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  61.33 
 
 
103 aa  94.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  49.41 
 
 
109 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  49.44 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  41.75 
 
 
168 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  47.25 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  54.65 
 
 
106 aa  91.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  47.25 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  54.65 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  53.16 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.12 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  46.6 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  41.12 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  54.43 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  54.43 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
111 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  51.9 
 
 
110 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  51.9 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  51.9 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  53.25 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  51.9 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  46.74 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  53.16 
 
 
111 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  50.62 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  49.35 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  45.68 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.57 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  42 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  41.24 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  41.24 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 
178 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
106 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  39.53 
 
 
110 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 
106 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  43.96 
 
 
133 aa  84  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  50.65 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  51.85 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  48.51 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  50.62 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  39.25 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  50.62 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  45.68 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  40.62 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 
91 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  53.25 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  41.94 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  41.24 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  47.3 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  42.31 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  39.6 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  35.94 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  46.34 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  52.11 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  49.25 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  57.58 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  46.84 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>