155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1890 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  100 
 
 
391 aa  777    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  30.33 
 
 
462 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  47.78 
 
 
205 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  40.23 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.11 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.11 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  38.54 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  31.78 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  34.83 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  41.56 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  34.83 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  36.05 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  27.36 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  31.82 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  31.19 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  32.18 
 
 
203 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  34.83 
 
 
131 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  31.46 
 
 
207 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.44 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  33.33 
 
 
204 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  32.58 
 
 
207 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  32.58 
 
 
207 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  33.33 
 
 
205 aa  63.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  30.23 
 
 
206 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  32.58 
 
 
206 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  31.46 
 
 
207 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  33.65 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  30.34 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35.06 
 
 
217 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  35.96 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  31.46 
 
 
207 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  31.46 
 
 
206 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  31.76 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.89 
 
 
206 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  26.71 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.84 
 
 
404 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  34 
 
 
413 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  38.1 
 
 
228 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  33.71 
 
 
342 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  29.41 
 
 
206 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  29.17 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  29.89 
 
 
207 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  25.41 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  40 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  30.95 
 
 
202 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  28.74 
 
 
219 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  26.8 
 
 
223 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  29.76 
 
 
467 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  32.18 
 
 
223 aa  56.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  32.58 
 
 
305 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3238  tonB protein, putative  32.56 
 
 
274 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  32.14 
 
 
202 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  32.77 
 
 
240 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.29 
 
 
237 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  28.38 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  31.43 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  28.75 
 
 
206 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  33.33 
 
 
242 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  31.93 
 
 
242 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  38.75 
 
 
302 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  31.93 
 
 
242 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  29.52 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  34.34 
 
 
565 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  33.33 
 
 
240 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  38.03 
 
 
239 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  28.38 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  28.38 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  39.68 
 
 
239 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  39.68 
 
 
239 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  28.09 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  39.68 
 
 
239 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  39.68 
 
 
244 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  39.68 
 
 
239 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  32.84 
 
 
115 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  31.08 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  39.68 
 
 
239 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  31.08 
 
 
370 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  39.68 
 
 
243 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  32.39 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  35.21 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  31.08 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  33.33 
 
 
210 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  31.11 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  39.68 
 
 
244 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
283 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.14 
 
 
259 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 
582 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  34.12 
 
 
290 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  32.81 
 
 
93 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  36.51 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  32.43 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.62 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  39.68 
 
 
248 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>