More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1860 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  716    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  37.01 
 
 
409 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 
401 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  35.37 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  36.94 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 
373 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  35.97 
 
 
357 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 
373 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  33.55 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  30.65 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  31.74 
 
 
378 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  29.79 
 
 
364 aa  106  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  42.11 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  25.62 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  36.13 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  27.54 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  25.47 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  24.18 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.96 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.95 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.29 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  37.39 
 
 
193 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  24.77 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 
454 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.63 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  39.02 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  28.14 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  33.91 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.45 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  30.2 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  34.01 
 
 
195 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  36.45 
 
 
172 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 
170 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.23 
 
 
468 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
204 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 
204 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.78 
 
 
658 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2621  porin opacity type  29.26 
 
 
275 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120074  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 
278 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  29.53 
 
 
195 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3065  porin opacity type  29.55 
 
 
270 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1225  porin opacity type  29.03 
 
 
284 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.25 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.77 
 
 
188 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 
637 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3165  porin, opacity type  29.67 
 
 
282 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404093  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  31.78 
 
 
273 aa  62.8  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.06 
 
 
185 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.19 
 
 
231 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  29.56 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  27.08 
 
 
227 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 
232 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
230 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  31.78 
 
 
156 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0832  heat resistant agglutinin 1  31.58 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000970612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 
230 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 
237 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  29.93 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
498 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 
179 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  26.22 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
230 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  33.33 
 
 
196 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  26.22 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4551  porin opacity type  26.55 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 
195 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  28.19 
 
 
202 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.83 
 
 
542 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.17 
 
 
222 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.98 
 
 
173 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
200 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 
207 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  26.87 
 
 
199 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3337  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.45 
 
 
242 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  23.83 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  37.62 
 
 
166 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  28.16 
 
 
212 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  24.68 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  25.1 
 
 
245 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  37.62 
 
 
168 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  27.63 
 
 
172 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  37.62 
 
 
169 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
230 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  28.27 
 
 
224 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  35.29 
 
 
402 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 
324 aa  59.7  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  31.41 
 
 
193 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 
205 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 
162 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 
163 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  33.33 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  36.73 
 
 
177 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.68 
 
 
226 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 
180 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>