More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1792 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  77.98 
 
 
279 aa  431  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  77.7 
 
 
280 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  78.7 
 
 
278 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  76.26 
 
 
280 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  75.9 
 
 
280 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  75.45 
 
 
279 aa  417  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1617  50S ribosomal protein L2  79.5 
 
 
279 aa  414  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  74.73 
 
 
279 aa  414  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  74.73 
 
 
279 aa  414  1e-115  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1843  50S ribosomal protein L2  76.62 
 
 
278 aa  410  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0328595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  75.54 
 
 
278 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  75.09 
 
 
278 aa  405  1e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1433  50S ribosomal protein L2  74.82 
 
 
278 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  0.0219433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1959  50S ribosomal protein L2  75.45 
 
 
277 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0386068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  75.09 
 
 
277 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  74.1 
 
 
278 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2298  50S ribosomal protein L2  74.82 
 
 
278 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1335  50S ribosomal protein L2  75.18 
 
 
278 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0836019 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  75.09 
 
 
277 aa  400  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3664  50S ribosomal protein L2  73.38 
 
 
278 aa  400  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2815  50S ribosomal protein L2  73.74 
 
 
278 aa  399  1e-110  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1252  50S ribosomal protein L2  75.54 
 
 
278 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.275281  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  74.73 
 
 
277 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  6.26221e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  74.73 
 
 
277 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.71407e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1350  50S ribosomal protein L2  73.02 
 
 
278 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3445  50S ribosomal protein L2  72.92 
 
 
277 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  72.66 
 
 
279 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  71.12 
 
 
277 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  72.56 
 
 
277 aa  388  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1367  50S ribosomal protein L2  72.2 
 
 
277 aa  388  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.266089  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1682  50S ribosomal protein L2  72.2 
 
 
277 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463749  hitchhiker  1.49038e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  69.06 
 
 
279 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2443  50S ribosomal protein L2  71.58 
 
 
278 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2165  50S ribosomal protein L2  71.58 
 
 
278 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1357  50S ribosomal protein L2  68.35 
 
 
279 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.184496  normal  0.0354969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  70.96 
 
 
276 aa  374  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  71.32 
 
 
277 aa  374  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2126  50S ribosomal protein L2  70.5 
 
 
278 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2221  50S ribosomal protein L2  69.42 
 
 
278 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0350  50S ribosomal protein L2  67.63 
 
 
278 aa  362  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1911  50S ribosomal protein L2  67.99 
 
 
278 aa  362  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00546363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  65.22 
 
 
277 aa  350  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  1.30499e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
277 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 
276 aa  336  3e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  62.13 
 
 
274 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33663e-07  hitchhiker  8.56838e-12 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
274 aa  328  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 
274 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.15964e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 
274 aa  328  8e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.0829e-09  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 
274 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 
275 aa  327  1e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  57.04 
 
 
279 aa  325  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  56.73 
 
 
275 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 
274 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.06039e-07  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  60.66 
 
 
273 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.37187e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.2222e-06  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.01214e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.57775e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12597e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 
274 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  60.74 
 
 
273 aa  323  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.50454e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  58.82 
 
 
273 aa  323  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  3.94369e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.93877e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
273 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 
273 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.91678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 
274 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.4248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 
274 aa  321  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 
274 aa  321  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29312e-15 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 
273 aa  321  9e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  58.03 
 
 
276 aa  320  1e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  1.65173e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 
273 aa  320  1e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  57.3 
 
 
276 aa  321  1e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 
273 aa  320  1e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  3.02361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  59.56 
 
 
273 aa  320  1e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3521  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 
275 aa  319  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  2.87143e-05  hitchhiker  1.19311e-06 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 
275 aa  319  4e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
276 aa  319  4e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 
274 aa  318  4e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.47453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  56.78 
 
 
276 aa  318  5e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.24196e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 
277 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
276 aa  318  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  3.71548e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 
277 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  55.56 
 
 
279 aa  318  6e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  56.62 
 
 
273 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  58.46 
 
 
274 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  57.51 
 
 
276 aa  318  9e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  4.77294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  57.14 
 
 
276 aa  318  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0497  50S ribosomal protein L2  58.61 
 
 
275 aa  316  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  3.98645e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  59.78 
 
 
276 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0326  ribosomal protein L2  62.5 
 
 
274 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.80771e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001739  LSU ribosomal protein L2p (L8e)  61.31 
 
 
274 aa  316  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.88228e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>