More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1780 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 177 aa  353  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  240  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  224  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  217  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  213  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  200  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  190  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 178 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  49.43 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>