253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1777 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  77.19 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  72.41 
 
 		 62 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  74.14 
 
 		 66 aa  87.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1382  50S ribosomal protein L30  68.33 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.773605  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 62 aa  85.5  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  73.68 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3430  50S ribosomal protein L30  70 
 
 		 64 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  68.33 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3166  50S ribosomal protein L30  68.33 
 
 		 64 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.146621  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 65 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 60 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1563  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.17266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  63.93 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  65 
 
 		 60 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  63.93 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 62 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  62.3 
 
 		 64 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  65.57 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2313  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.415708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 62 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  72.73 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 62 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 62 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1926  50S ribosomal protein L30  62.3 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0335  50S ribosomal protein L30  63.33 
 
 		 63 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.623438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 63 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 63 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  65.45 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3649  50S ribosomal protein L30  61.67 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 62 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  63.79 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  63.79 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 58 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0716  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.142124  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  57.38 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  56.9 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  57.14 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  50.85 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 58 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000247564  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>