More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1737 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
584 aa  1171    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  45.37 
 
 
599 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  36.52 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 
583 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  35.99 
 
 
577 aa  273  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  34.39 
 
 
598 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.39 
 
 
624 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  31.82 
 
 
621 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
639 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  31.13 
 
 
1048 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  30.27 
 
 
583 aa  200  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.3 
 
 
597 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  31.25 
 
 
1065 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
594 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  24.41 
 
 
1408 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.13 
 
 
748 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  28.79 
 
 
1275 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  27.08 
 
 
1085 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  24.82 
 
 
1588 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.35 
 
 
740 aa  123  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  28.57 
 
 
1546 aa  116  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32.01 
 
 
323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.29 
 
 
323 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.32 
 
 
272 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.12 
 
 
760 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  28.41 
 
 
256 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  32.84 
 
 
314 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  32.84 
 
 
314 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  32.84 
 
 
314 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  32.84 
 
 
314 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  32.84 
 
 
314 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.09 
 
 
324 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  32.84 
 
 
314 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  33.87 
 
 
301 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  33.87 
 
 
301 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  33.87 
 
 
301 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.33 
 
 
327 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  32.22 
 
 
319 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  27.59 
 
 
315 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.96 
 
 
335 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  35.03 
 
 
262 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  33.33 
 
 
326 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  27.01 
 
 
754 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  29.67 
 
 
293 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  37.34 
 
 
287 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  35.16 
 
 
314 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.68 
 
 
275 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  35.96 
 
 
311 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.35 
 
 
320 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  33.85 
 
 
315 aa  97.8  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  33.85 
 
 
315 aa  97.8  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.3 
 
 
311 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  31.11 
 
 
318 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.11 
 
 
318 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  32.8 
 
 
303 aa  97.1  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.33 
 
 
767 aa  97.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.24 
 
 
263 aa  96.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.52 
 
 
323 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  37.17 
 
 
343 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.38 
 
 
275 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  25.65 
 
 
250 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.1 
 
 
740 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  28.38 
 
 
280 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.26 
 
 
335 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  34.83 
 
 
310 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  26.79 
 
 
738 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  33.51 
 
 
300 aa  95.9  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.52 
 
 
323 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  35.59 
 
 
333 aa  95.5  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35.23 
 
 
311 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.02 
 
 
734 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  28.9 
 
 
263 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  28.31 
 
 
263 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  25.79 
 
 
737 aa  94.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.92 
 
 
796 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1570  patatin  31.84 
 
 
360 aa  94.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  35.23 
 
 
328 aa  94.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  31.13 
 
 
798 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.85 
 
 
253 aa  94  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.67 
 
 
273 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  29.8 
 
 
252 aa  93.6  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  35.98 
 
 
317 aa  93.6  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  35.45 
 
 
317 aa  93.6  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  24.91 
 
 
735 aa  93.6  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.33 
 
 
320 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33.33 
 
 
320 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  33.33 
 
 
321 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.09 
 
 
320 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  28.44 
 
 
263 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.81 
 
 
803 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  32.62 
 
 
301 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.09 
 
 
320 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.09 
 
 
333 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  30.73 
 
 
347 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.81 
 
 
803 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.81 
 
 
803 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28.96 
 
 
667 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.22 
 
 
301 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  33.16 
 
 
343 aa  91.3  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.48 
 
 
327 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>