40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1696 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1696  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
90 aa  188  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000227045  decreased coverage  0.00292714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1527  hypothetical protein  61.97 
 
 
91 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.924087  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2849  Sel1 domain-containing protein  47.19 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0412947  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4428  Sel1 domain-containing protein  58.57 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4706  hypothetical protein  46.59 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0626752  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0966  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.85 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.853477  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3102  Sel1 repeat-containing protein  54.05 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.24 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.337036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2442  hypothetical protein  49.23 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3012  hypothetical protein  49.23 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.500219 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3004  Sel1  57.38 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_004310  BR0629  hypothetical protein  41.67 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0626  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0917  hypothetical protein  43.08 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2653  hypothetical protein  46.88 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2272  hypothetical protein  48.44 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355382  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1995  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.382261  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1119  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.25 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2268  hypothetical protein  41.67 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1420  hypothetical protein  37.14 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2787  Sel1 domain-containing protein  48.48 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  44.26 
 
 
489 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  44.26 
 
 
246 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  39.06 
 
 
295 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  40.91 
 
 
241 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0664  Sel1 domain-containing protein  48.44 
 
 
88 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865125  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.33 
 
 
1261 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.68 
 
 
223 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  37.66 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 
293 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
1110 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  54.29 
 
 
274 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 
1059 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  35 
 
 
1086 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2484  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
287 aa  40.8  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  36.84 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
1081 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.67 
 
 
565 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2104  Sel1 domain-containing protein  35.82 
 
 
177 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.977268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>