237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1693 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1693  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
421 aa  815    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000207824  decreased coverage  0.00534917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 
431 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  24.8 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 
415 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 
440 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.82 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.28 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  25.8 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  20.6 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  23.31 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 
450 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  21.38 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2575  RND family efflux transporter MFP subunit  20.38 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.33 
 
 
392 aa  63.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  22.14 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.38 
 
 
462 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 
417 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2477  RND family efflux transporter MFP subunit  19.71 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  22.85 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  21.68 
 
 
348 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  23.84 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  23.84 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  21.84 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  29.03 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.91 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.3 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  22.47 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3005  RND family efflux transporter MFP subunit  19.95 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000258393  hitchhiker  0.0000478824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  30.5 
 
 
323 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.6 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 
340 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  32.22 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  28.08 
 
 
323 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  20.44 
 
 
423 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 
353 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  25.79 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.19 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 
416 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 
365 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  24.87 
 
 
409 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
378 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.52 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 
390 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  22.36 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.04 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  40.45 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.76 
 
 
476 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  24.47 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  28.36 
 
 
394 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.11 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 
365 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 
365 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.11 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 
357 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.81 
 
 
367 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.11 
 
 
371 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 
354 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  27.71 
 
 
360 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.11 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3255  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.11 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  26.38 
 
 
514 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.11 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  24.11 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1902  membrane-fusion protein  28.42 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0558652  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  28.43 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  22.44 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.11 
 
 
371 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  25.56 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.59 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 
737 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  24.28 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>