More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1666 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
355 aa  725    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.91 
 
 
363 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  58.33 
 
 
363 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  59.26 
 
 
357 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  58.33 
 
 
363 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.4 
 
 
357 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  55.93 
 
 
352 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  48.72 
 
 
354 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  49.72 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  41.79 
 
 
349 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 
348 aa  215  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
348 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.49 
 
 
347 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
346 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
347 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
352 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
325 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  38.89 
 
 
340 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.23 
 
 
341 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.23 
 
 
341 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.73 
 
 
319 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  34.93 
 
 
332 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  33.71 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  35.46 
 
 
331 aa  140  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
346 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  35.14 
 
 
328 aa  135  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 
347 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  30.9 
 
 
328 aa  133  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
351 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  32.79 
 
 
346 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  29.43 
 
 
357 aa  122  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  32.25 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  31.13 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
332 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  34.62 
 
 
335 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
332 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  29.41 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  29.03 
 
 
336 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  30.43 
 
 
339 aa  109  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  32.09 
 
 
336 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  28.73 
 
 
335 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  31.78 
 
 
322 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  28.93 
 
 
343 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  31.85 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
329 aa  96.3  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  27.97 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  26.54 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  29.74 
 
 
334 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.1 
 
 
329 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  29.58 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  31.89 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  28.97 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  27.32 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
339 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.65 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.61 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  32.23 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.09 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.25 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.77 
 
 
334 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  29.25 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.8 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.84 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
329 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.55 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06133  hypothetical protein  38.66 
 
 
130 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01033  hypothetical protein  38.66 
 
 
130 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00365727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  25.57 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01625  dihydroflavonol 4-reductase family protein  27.76 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.86 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>