More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1617 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  71.58 
 
 
104 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.81 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
123 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
114 aa  92  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
114 aa  92  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  44.57 
 
 
114 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
112 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.25 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  38.61 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  44.68 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  46.24 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  42.2 
 
 
117 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
94 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
116 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  41.24 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2896  regulatory protein ArsR  51.04 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  47.56 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  40.43 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
102 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
102 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
101 aa  84.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.6 
 
 
101 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  45.1 
 
 
124 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
113 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 
140 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
110 aa  83.6  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  44.09 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  38.24 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.12 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  37.11 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  41.98 
 
 
87 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  41.24 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  40.2 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 
97 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
96 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2290  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  40.4 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  38.54 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  44.87 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  44.87 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  46.34 
 
 
227 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  51.39 
 
 
119 aa  77  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>