More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1609 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 684 aa  1372    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  43.93 
 
 		 702 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  37.88 
 
 		 725 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  36.25 
 
 		 670 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 735 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 781 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 708 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1896  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  33.13 
 
 		 687 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 711 aa  252  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 705 aa  230  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 702 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 705 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 757 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 779 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 730 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 717 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  22.83 
 
 		 705 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01819  outer membrane receptor protein, most likely Fe transport  25.39 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 688 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 694 aa  78.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 733 aa  77.8  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.19 
 
 		 710 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.95 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 675 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.37 
 
 		 631 aa  72  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.86 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 707 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0836  TonB-dependent receptor for iron transport  22.34 
 
 		 683 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0639266  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  34.62 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 716 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 741 aa  67.4  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3340  TonB-dependent receptor, putative  21.39 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 743 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1855  TonB-dependent receptor, putative  22.41 
 
 		 693 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.51 
 
 		 623 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 732 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 742 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2410  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 683 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 644 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 678 aa  63.9  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 697 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 780 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 698 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.54 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.56 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.54 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.54 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.54 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  23.45 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0747  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.582563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.54 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.54 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.93 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.93 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.93 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.52 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.93 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 713 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.56 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.43 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 864 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.54 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02129  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 667 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  28 
 
 		 618 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.56 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>