More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1558 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
613 aa  1225    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  51.22 
 
 
619 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  36.26 
 
 
608 aa  349  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.94 
 
 
588 aa  326  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.83 
 
 
588 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  35.8 
 
 
623 aa  300  5e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  32.88 
 
 
609 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.93 
 
 
589 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.97 
 
 
622 aa  291  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.92 
 
 
588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.76 
 
 
602 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  34.27 
 
 
592 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  30.61 
 
 
610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.52 
 
 
596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.11 
 
 
591 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.66 
 
 
618 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33 
 
 
593 aa  278  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 
592 aa  278  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 
592 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.84 
 
 
588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.55 
 
 
627 aa  273  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.24 
 
 
612 aa  273  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.91 
 
 
616 aa  273  9e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 
592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  30.48 
 
 
592 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.76 
 
 
596 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.78 
 
 
597 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.32 
 
 
609 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  31.86 
 
 
596 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.52 
 
 
596 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  31.55 
 
 
592 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  31.55 
 
 
592 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.85 
 
 
591 aa  263  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.46 
 
 
588 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.02 
 
 
605 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.47 
 
 
613 aa  259  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.9 
 
 
601 aa  259  9e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.93 
 
 
588 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.62 
 
 
599 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.45 
 
 
589 aa  257  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 
593 aa  256  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  27.98 
 
 
624 aa  256  9e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  33.9 
 
 
618 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.25 
 
 
596 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.88 
 
 
605 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.77 
 
 
605 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 
592 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32 
 
 
598 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.33 
 
 
609 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.88 
 
 
602 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  31.81 
 
 
602 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.8 
 
 
602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  30.1 
 
 
606 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  33.64 
 
 
599 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.48 
 
 
606 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.67 
 
 
588 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.86 
 
 
609 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.27 
 
 
609 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  31.05 
 
 
609 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.13 
 
 
592 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.09 
 
 
588 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  32.02 
 
 
596 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  31.38 
 
 
613 aa  230  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  30.58 
 
 
602 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.98 
 
 
609 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.67 
 
 
588 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.94 
 
 
581 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  29.1 
 
 
622 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.7 
 
 
611 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.74 
 
 
609 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.01 
 
 
587 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.18 
 
 
614 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 
605 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.06 
 
 
609 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  30.84 
 
 
609 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.28 
 
 
610 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  27.65 
 
 
590 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.9 
 
 
594 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.28 
 
 
610 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  29.82 
 
 
600 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.29 
 
 
590 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.69 
 
 
634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 
591 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.2 
 
 
610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.2 
 
 
630 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  27.2 
 
 
610 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  28.35 
 
 
590 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  30.33 
 
 
603 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  28.23 
 
 
588 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.11 
 
 
608 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.72 
 
 
632 aa  210  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.38 
 
 
583 aa  209  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.45 
 
 
616 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.26 
 
 
610 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.72 
 
 
620 aa  206  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  27.75 
 
 
574 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  27.74 
 
 
574 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  28.47 
 
 
574 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  27.65 
 
 
641 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>