More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1522 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 101 aa  198  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  70.21 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  70.21 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  70.21 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  68.37 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  64.95 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  64.89 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  67.02 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  63 
 
 		 104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  68.48 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  61.62 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  69.57 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  61.86 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  61.86 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  63.16 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  60.82 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  65.26 
 
 		 105 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  60 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  59.38 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  60.64 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  58.95 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  58.95 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  63.44 
 
 		 98 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  58.95 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  59.57 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  60.64 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  60.64 
 
 		 97 aa  119  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  59 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  58.51 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  60.22 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  55.56 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  60.22 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  59.14 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 113 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  54.35 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  51.58 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  51.58 
 
 		 96 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  52.33 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  50.54 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  49.45 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  45.05 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  53.85 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  50.55 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  51.65 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  46.24 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  49.47 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  51.58 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  51.65 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 98 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 98 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  52.22 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 98 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  49.45 
 
 		 99 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  50.52 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  48.96 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  48.45 
 
 		 99 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  51.06 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  52.17 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  52.17 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  52.17 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  47.87 
 
 		 99 aa  98.6  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  52.17 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  51.06 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  52.17 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 98 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  52.17 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  52.17 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>