More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1513 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 
165 aa  332  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  79.43 
 
 
155 aa  226  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  69.09 
 
 
160 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  68.67 
 
 
158 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  68.67 
 
 
158 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  68.67 
 
 
158 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  69.7 
 
 
160 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  68.52 
 
 
160 aa  222  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
164 aa  222  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  69.28 
 
 
162 aa  221  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  68.71 
 
 
160 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  68.71 
 
 
160 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  76.92 
 
 
155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  67.88 
 
 
161 aa  220  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  75 
 
 
157 aa  219  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  68.48 
 
 
164 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  67.68 
 
 
166 aa  218  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  76.55 
 
 
155 aa  216  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  66.27 
 
 
158 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  76.6 
 
 
155 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  67.47 
 
 
158 aa  216  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  67.88 
 
 
159 aa  215  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  63.64 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
159 aa  214  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  66.26 
 
 
161 aa  214  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  67.3 
 
 
163 aa  214  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  65.68 
 
 
158 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  67.27 
 
 
159 aa  212  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  66.88 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  73.94 
 
 
158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  65.03 
 
 
160 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  64.38 
 
 
160 aa  210  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  65.66 
 
 
161 aa  210  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  67.08 
 
 
161 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  65 
 
 
162 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  62.65 
 
 
165 aa  207  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 
161 aa  206  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 
161 aa  206  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  66.46 
 
 
161 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  67.61 
 
 
180 aa  204  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  72.39 
 
 
188 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 
130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 
152 aa  159  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 
149 aa  158  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  60.16 
 
 
130 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  61.29 
 
 
129 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  61.29 
 
 
129 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 
130 aa  154  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 
130 aa  151  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
130 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  57.26 
 
 
130 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  56.06 
 
 
151 aa  149  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 
130 aa  147  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  144  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  50.7 
 
 
145 aa  144  7.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
131 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
130 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 
130 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  53.38 
 
 
137 aa  141  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  141  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
130 aa  140  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  57.6 
 
 
130 aa  140  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  140  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  140  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>