More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1449 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  100 
 
 		 450 aa  897    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  51.37 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  53.39 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  53.56 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  52.36 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  50.45 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  53.58 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  54.05 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  52.94 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  53.16 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  51.28 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  52.94 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  53 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  52.62 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  52 
 
 		 442 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.3 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  51.27 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  50.69 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.64 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  50.83 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  52.48 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  49.88 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  53.55 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  51.24 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  50 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  52.33 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  52.48 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  49.44 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  52.79 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  53.28 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  51.83 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  50.83 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  50.83 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  50.34 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  50.51 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  51.79 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  53.03 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  50.36 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  52.05 
 
 		 415 aa  359  6e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  49.14 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  48.38 
 
 		 448 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  52.36 
 
 		 432 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  48.2 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  47.12 
 
 		 430 aa  309  8e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.75 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  47.61 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.68 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42.01 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  41.78 
 
 		 414 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.69 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  45.08 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.48 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.15 
 
 		 421 aa  295  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.26 
 
 		 429 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.72 
 
 		 436 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  45.84 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.7 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  43.04 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  42 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.07 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  44.73 
 
 		 426 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 426 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  44.75 
 
 		 415 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.86 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.59 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  44.73 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.59 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  44.16 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  48.25 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  42.82 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  41.9 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  48.55 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  43.7 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  41.9 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  43.35 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  41.9 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  48.55 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  41.74 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  43.35 
 
 		 489 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  44.91 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  44.91 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.02 
 
 		 444 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  45.41 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  41.32 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  40.22 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  44.74 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  44.12 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  45.14 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>