170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1437 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  100 
 
 
166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  42.34 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  41.3 
 
 
150 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  41.61 
 
 
151 aa  104  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  39.13 
 
 
150 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  40 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  38.24 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  38.78 
 
 
153 aa  97.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  40 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  40 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  36.76 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  36.99 
 
 
158 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  37.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  38.57 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  34.56 
 
 
149 aa  90.5  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  36.84 
 
 
157 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  34.48 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  37.33 
 
 
157 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 
155 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 
147 aa  88.2  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  38.3 
 
 
152 aa  87.8  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  39.66 
 
 
150 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  38.98 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  36.69 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  36.69 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  35.25 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  34.72 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  37.07 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  37.07 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  33.8 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  31.88 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  33.82 
 
 
152 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  31.29 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  35.77 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  35.61 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  29.05 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  26.53 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  27.52 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  34.64 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  29.05 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  29.05 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  28.19 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  25.85 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  35.34 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  24.49 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1617  hypothetical protein  31.79 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.441973  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  29.05 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  25.74 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  25.74 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  25.74 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  25.74 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  33.8 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  25.74 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  25.74 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  25.74 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  28.83 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  25.74 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  29.46 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  27.7 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  30.88 
 
 
148 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  28.47 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  28.89 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  30.15 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  28.78 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  31.65 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  24.49 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  24.49 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  28.06 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>