81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1352 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  100 
 
 		 519 aa  1002    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  49.42 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  42.37 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  42.32 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  45.33 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  43.09 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  43.23 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  41.57 
 
 		 519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  44.47 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  45.13 
 
 		 519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  41.16 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  44.85 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  42.51 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  45.05 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  46.22 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  44.85 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  42.63 
 
 		 518 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  42.97 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  44.71 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  44.25 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  44.51 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  44.01 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  42.83 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  43.92 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  44.31 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  43.33 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  42.94 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  42.88 
 
 		 534 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  42.19 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  42.77 
 
 		 538 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  44.31 
 
 		 511 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  42.61 
 
 		 528 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  42.97 
 
 		 538 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  42.58 
 
 		 539 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  43.61 
 
 		 534 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  41.49 
 
 		 535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  42.88 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  41.8 
 
 		 539 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  39.44 
 
 		 511 aa  349  9e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  42.16 
 
 		 532 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  36.14 
 
 		 520 aa  342  8e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.91 
 
 		 510 aa  322  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.91 
 
 		 510 aa  322  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.91 
 
 		 508 aa  322  8e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  37.91 
 
 		 508 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  37.91 
 
 		 508 aa  322  8e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.91 
 
 		 508 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  37.91 
 
 		 508 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  37.91 
 
 		 508 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  36.95 
 
 		 514 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  35.35 
 
 		 509 aa  317  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  37.25 
 
 		 506 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.44 
 
 		 507 aa  309  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  36.42 
 
 		 518 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  36.22 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  34.7 
 
 		 508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  35.64 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  34.13 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  34.13 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  37.32 
 
 		 585 aa  296  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  33.53 
 
 		 523 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  34.14 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  39.73 
 
 		 305 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  35 
 
 		 263 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01760  hypothetical protein  23.28 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2374  hypothetical protein  34.83 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1502  hypothetical protein  32.58 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0766  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  26.63 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.607983  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  22.54 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0456304 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1496  hypothetical protein  32.91 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1557  hypothetical protein  32.91 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.750418  normal  0.28282 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1891  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  29.71 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1563  hypothetical protein  32.58 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.150626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1005  hypothetical protein  34.85 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1678  hypothetical protein  31.65 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2876  hypothetical protein  31.31 
 
 		 513 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1715  hypothetical protein  32.05 
 
 		 513 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1145  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  36.23 
 
 		 464 aa  44.3  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0199  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  36.92 
 
 		 505 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2386  hypothetical protein  31.65 
 
 		 509 aa  43.5  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  35.82 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>