More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1241 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1241  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 
412 aa  820    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0151467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  43.88 
 
 
1075 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  43.88 
 
 
1075 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  43.88 
 
 
1063 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  42.86 
 
 
1080 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  41.84 
 
 
1089 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  41.84 
 
 
1075 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  41.84 
 
 
1089 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  40.78 
 
 
1092 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  40.82 
 
 
1067 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  36.73 
 
 
1102 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  38.78 
 
 
1092 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  26.27 
 
 
520 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  36.73 
 
 
1131 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  24.38 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  38.38 
 
 
1074 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  38.78 
 
 
717 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3319  transcriptional regulatory protein-like protein  34.04 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.389048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3384  transcriptional regulator, CadC  33.72 
 
 
693 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  37.11 
 
 
512 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04004  DNA-binding transcriptional activator  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3858  transcriptional regulator, CadC  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3894  DNA-binding transcriptional activator CadC  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4602  DNA-binding transcriptional activator CadC  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00143405  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  37.27 
 
 
945 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03966  hypothetical protein  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.992437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4374  DNA-binding transcriptional activator CadC  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00319503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5649  DNA-binding transcriptional activator CadC  37.11 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000157695  normal  0.551738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0607  putative transcriptional regulator, CadC  35.2 
 
 
729 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.178679 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
712 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0918  transcriptional regulator, CadC  35.79 
 
 
725 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  32.04 
 
 
1124 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  34.78 
 
 
711 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2933  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.08 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00185207  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2758  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.08 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00262539  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2799  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.08 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0038279  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2820  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.08 
 
 
514 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0342818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
597 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2713  transcriptional activator CadC  36.08 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  40.79 
 
 
1020 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0563  transcriptional regulatory protein-like protein  30.39 
 
 
678 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0437  transcriptional regulatory protein-like protein  30.85 
 
 
762 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000809247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  28.87 
 
 
756 aa  63.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
808 aa  63.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3769  DNA-binding transcriptional activator CadC  34.34 
 
 
518 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000389639  normal  0.0128814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2656  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.59 
 
 
541 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4558  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.63 
 
 
323 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  34.18 
 
 
711 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.79 
 
 
490 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002187  transcriptional activator of cad operon  32.95 
 
 
522 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000411708  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 
956 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.38 
 
 
928 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3081  invasion protein regulator  39.13 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3186  invasion protein regulator  39.13 
 
 
555 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.735415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
3145 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2494  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.99 
 
 
542 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2998  invasion protein regulator  39.13 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000362876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3029  invasion protein regulator  39.13 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0229765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3065  invasion protein regulator  39.13 
 
 
553 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.359189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32.24 
 
 
700 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  35.29 
 
 
518 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  37.31 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  38.36 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00207  DNA-binding transcriptional activator CadC  36.36 
 
 
523 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  31.31 
 
 
522 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  34.67 
 
 
522 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5304  transcriptional regulator, CadC  35.53 
 
 
382 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  28.16 
 
 
977 aa  57.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 
946 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  37.31 
 
 
292 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  30.38 
 
 
565 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 
1056 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30 
 
 
661 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2883  transcriptional regulator domain-containing protein  34.21 
 
 
716 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.0000000742237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2965  transcriptional regulator domain-containing protein  34.21 
 
 
716 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00199161  normal  0.0124128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  36.05 
 
 
525 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  26.22 
 
 
515 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  27.45 
 
 
521 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0794  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  36.25 
 
 
724 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  35.37 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2552  transcriptional regulator, CadC  31.63 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2507  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  31.63 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2544  transcriptional regulator, CadC  31.63 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
542 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  29 
 
 
521 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  30.71 
 
 
591 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1311  transcriptional regulator  34.26 
 
 
262 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  32.14 
 
 
774 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3415  transcriptional regulator, CadC  37.5 
 
 
436 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3751  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87227  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  28.69 
 
 
972 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  28.85 
 
 
950 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  30.4 
 
 
959 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  29.9 
 
 
504 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0652  transcriptional regulator  26.26 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  32.47 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2514  response regulator receiver  36.63 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3088  transcriptional regulator, CadC  32.97 
 
 
574 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
878 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  22.77 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>