More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1173 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0871  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.85 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.2 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.22 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  40 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  36.96 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  36.51 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  37.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  37.5 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.61 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.98 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  35.71 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  34.96 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.13 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  36.13 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  37.5 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  30.71 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  30.08 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  30.65 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0162  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  34.23 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.64 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  32.28 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  34.17 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.21 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.8 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.79 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  31.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  29.82 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  27.27 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  29.82 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  24.79 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  26.56 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  28.07 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.71 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.95 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  24.22 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  27.69 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1719  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00014535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.87 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.89 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1866  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.838345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.68 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  25 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  29.82 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  27.19 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.44 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  25.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  24.39 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  27.19 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  27.19 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.8 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  30.6 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  25.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  27.5 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.62 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>