15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1082 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1082  HfaB protein  100 
 
 		 334 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.167536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3727  HfaB protein  55.27 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2651  HfaB protein  52.65 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2748  HfaB protein  41.42 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.941879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6349  Putative protein involved in formation of curli polymers-like protein  37.45 
 
 		 467 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1066  curli production assembly/transport component CsgG  36.14 
 
 		 271 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1520  curli production assembly/transport component CsgG  29.37 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.301126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1820  curli production assembly/transport component CsgG  30.15 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010127  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2299  curli production assembly/transport component CsgG  29.95 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2474  curli production assembly/transport component CsgG  30.43 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3472  curli production assembly/transport component CsgG  29.95 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2465  curli production assembly/transport component CsgG  29.95 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1729  curli production assembly/transport component CsgG  30.15 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1993  curli production assembly/transport component CsgG  27.96 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00606032  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2419  curli production assembly/transport component CsgG  26.17 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>