201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0997 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  51.23 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  50.62 
 
 
266 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  50.62 
 
 
266 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  45 
 
 
281 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  40.35 
 
 
245 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  42.68 
 
 
254 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  44.12 
 
 
257 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  45.06 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  26.25 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  26.25 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  28.51 
 
 
439 aa  95.9  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  28.05 
 
 
443 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  28.95 
 
 
505 aa  91.7  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 
443 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.93 
 
 
437 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  26.7 
 
 
439 aa  88.6  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  26.29 
 
 
447 aa  86.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 
288 aa  82  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.43 
 
 
288 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.94 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  29.28 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.64 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  28.96 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  26.18 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.9 
 
 
290 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.09 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  29.59 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.09 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.84 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  26.94 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  27.85 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.43 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  33.85 
 
 
283 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.86 
 
 
313 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  28.06 
 
 
374 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.98 
 
 
313 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 
263 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.68 
 
 
301 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  24.03 
 
 
346 aa  61.6  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.26 
 
 
311 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.16 
 
 
373 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.26 
 
 
311 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.29 
 
 
311 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  31.33 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.2 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  31.15 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.46 
 
 
372 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 
373 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 
373 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  33.61 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.46 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 
373 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 
373 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 
373 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 
373 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.57 
 
 
313 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.06 
 
 
308 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
373 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  34.4 
 
 
373 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.43 
 
 
298 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  27.43 
 
 
318 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  23.96 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.59 
 
 
311 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
344 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.03 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  30.89 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 
373 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  31.85 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.2 
 
 
377 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  28.7 
 
 
312 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 
373 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  27.11 
 
 
320 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
373 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
373 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  25.66 
 
 
351 aa  55.5  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.13 
 
 
375 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.2 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>