More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0904 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  100 
 
 
527 aa  1072    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  55.13 
 
 
633 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  55.22 
 
 
615 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  51.8 
 
 
627 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  52.37 
 
 
637 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  54.48 
 
 
615 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  54.37 
 
 
615 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  51.61 
 
 
627 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  51.71 
 
 
629 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  54.1 
 
 
642 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  55.79 
 
 
618 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  54.46 
 
 
615 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  51.62 
 
 
625 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.04 
 
 
639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  52.12 
 
 
625 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  50.67 
 
 
625 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  49.72 
 
 
621 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  49.53 
 
 
620 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  50.29 
 
 
625 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  48.28 
 
 
627 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  49.91 
 
 
621 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  51.15 
 
 
623 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
622 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  51.05 
 
 
623 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  49.43 
 
 
627 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  48.57 
 
 
640 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
627 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  48.86 
 
 
621 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  49.33 
 
 
645 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  49.24 
 
 
625 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  49.33 
 
 
619 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  49.43 
 
 
626 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2537  ABC transporter related  50.85 
 
 
627 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265447  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  47.7 
 
 
627 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  49.23 
 
 
626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2171  ABC transporter related  51.34 
 
 
542 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  47.89 
 
 
625 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  47.13 
 
 
625 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  46.93 
 
 
634 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  46.93 
 
 
631 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  47.61 
 
 
622 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  49.14 
 
 
625 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  43.42 
 
 
628 aa  417  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
637 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.56 
 
 
635 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 
635 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 
635 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  42.69 
 
 
635 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  41.78 
 
 
636 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
637 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 
635 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 
635 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
637 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
637 aa  398  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
637 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 
635 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
634 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 
639 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 
635 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 
640 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 
640 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 
640 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 
641 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  40.19 
 
 
648 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 
634 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
635 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
638 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  41.39 
 
 
659 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  40.3 
 
 
636 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  41.39 
 
 
639 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
624 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  39.25 
 
 
636 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  40.73 
 
 
633 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  40.38 
 
 
644 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  40.68 
 
 
636 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 
638 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  41.07 
 
 
635 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  40.68 
 
 
642 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 
651 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  40.15 
 
 
636 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  39.93 
 
 
673 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  41.46 
 
 
647 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.57 
 
 
638 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 
636 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  39.74 
 
 
636 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 
532 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  40.37 
 
 
687 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  38.37 
 
 
636 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
554 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  39.54 
 
 
633 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 
643 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
532 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 
676 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  37.52 
 
 
663 aa  365  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>