More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0871 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0871  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.85 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  36 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  35.82 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  36.57 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  36.72 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  37.8 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  36 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  31.71 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  30.08 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  30.89 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  33.33 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.75 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.14 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  34.19 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  33.83 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  30.83 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.77 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.43 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.95 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  34.17 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.87 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0162  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  28.12 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.37 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  22.48 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1866  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.838345 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  25.98 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.4 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.84 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.66 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  28 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  28 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.35 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  24.43 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  26.56 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  28.33 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.55 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  27.73 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.74 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  26.87 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  29.2 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.09 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  21.6 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.22 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  26.4 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.79 
 
 		 219 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  22.76 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.53 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.21 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.26 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.63 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.89 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.62 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.2 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.9 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02760  hypothetical protein  41.18 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>