More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0841 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
392 aa  795    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.11 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 
422 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.35 
 
 
389 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
399 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
385 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  27.24 
 
 
404 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 
390 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
377 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 
371 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.37 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  27.63 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
393 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  23.28 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 
106 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  29.3 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  21.81 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
760 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 
1201 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
532 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
154 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  32.22 
 
 
1296 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 
1374 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
269 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 
274 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 
337 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 
546 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 
276 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
271 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
265 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
533 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 
571 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3550  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 
745 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
940 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.91 
 
 
347 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 
745 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 
544 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
365 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 
286 aa  60.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  29.41 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  32.97 
 
 
287 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
303 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  24.79 
 
 
537 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 
255 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  31.97 
 
 
343 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  30 
 
 
266 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
296 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
299 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>