18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0806 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  37.78 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3938  PilT protein domain protein  36.63 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  29.55 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  34.07 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2119  PilT protein-like  35.54 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  38.05 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  26.97 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  28.03 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0599  hypothetical protein  29.73 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.459839  normal  0.795702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  28.45 
 
 		 131 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  29.51 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  28.67 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  36.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  27.42 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>