156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0712 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  100 
 
 
110 aa  216  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  51.89 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  44.87 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  44.44 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  48 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  40.51 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  44.44 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  37.18 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  37.97 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  39.74 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  37.97 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  37.97 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  37.97 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  44.44 
 
 
371 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.46 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  36.71 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  33.02 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  44.44 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.02 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  36.25 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  33.96 
 
 
403 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  45.9 
 
 
259 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  39.74 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  30.28 
 
 
205 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  37.18 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  38.46 
 
 
207 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  34.18 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.9 
 
 
207 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.9 
 
 
207 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  34.62 
 
 
206 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  38.46 
 
 
204 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  47.46 
 
 
277 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  34.62 
 
 
206 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  34.62 
 
 
206 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  34.18 
 
 
203 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  34.62 
 
 
206 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  39.68 
 
 
228 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  37.18 
 
 
206 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  44 
 
 
237 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  31.58 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  33.02 
 
 
206 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.39 
 
 
405 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35.82 
 
 
206 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  29.91 
 
 
206 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  29.91 
 
 
206 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  39.74 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  35.9 
 
 
219 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  46.77 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  42.11 
 
 
390 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  38.46 
 
 
340 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  35.9 
 
 
202 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  42.65 
 
 
215 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  34.57 
 
 
368 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  40.35 
 
 
342 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  45.31 
 
 
334 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.58 
 
 
417 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  31.65 
 
 
206 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  37.88 
 
 
305 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  30.26 
 
 
397 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30.77 
 
 
223 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  37.18 
 
 
205 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.91 
 
 
218 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  36.21 
 
 
270 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  36.71 
 
 
199 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  42.86 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.76 
 
 
467 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  31.75 
 
 
269 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  29.35 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  30.38 
 
 
243 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.33 
 
 
248 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0113  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.83 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.158306  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  28.12 
 
 
458 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  36.25 
 
 
462 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  27.06 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  38.18 
 
 
291 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  36.76 
 
 
362 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.58 
 
 
252 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  31.65 
 
 
244 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  35.09 
 
 
367 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  31.65 
 
 
243 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  31.65 
 
 
244 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  31.65 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  31.65 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  32.5 
 
 
392 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  31.65 
 
 
239 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.11 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  31.65 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  31.65 
 
 
239 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  36.07 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  31.75 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  38.98 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  38.6 
 
 
361 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.36 
 
 
283 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  38.33 
 
 
252 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  38.33 
 
 
256 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  38.33 
 
 
256 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  37.5 
 
 
290 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  24.66 
 
 
251 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>