21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0643 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  47.41 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  31.68 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  42.86 
 
 
133 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  28.44 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 
217 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  31.68 
 
 
133 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  35.38 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  38.36 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  38.36 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  39.13 
 
 
142 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  38.36 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
217 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  27.91 
 
 
153 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>