27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0570 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  33.49 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  41.43 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  29.07 
 
 
244 aa  92.4  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  39.29 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  33.11 
 
 
1052 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  34.23 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  35.59 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  36.07 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 
648 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
674 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  35.71 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  31.86 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  34.46 
 
 
668 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  28.89 
 
 
280 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  27.94 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  37.23 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  34.18 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  27.37 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  32.95 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0277  hypothetical protein  32.38 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1411  hypothetical protein  25.86 
 
 
305 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000180028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0446  hypothetical protein  35.29 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  45.8  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  26.79 
 
 
450 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>