More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0558 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  70.79 
 
 
430 aa  637  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
429 aa  864  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  69.63 
 
 
430 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  69.63 
 
 
448 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  69.63 
 
 
430 aa  627  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  68.38 
 
 
533 aa  621  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  69.63 
 
 
430 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 
430 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  68.62 
 
 
429 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  68.93 
 
 
430 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  68.62 
 
 
429 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  67.76 
 
 
430 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  69.14 
 
 
448 aa  612  1e-174  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  67.99 
 
 
430 aa  612  1e-174  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 
430 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 
430 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  66.05 
 
 
430 aa  607  1e-172  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  65.81 
 
 
457 aa  605  1e-172  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  66.28 
 
 
430 aa  607  1e-172  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  69 
 
 
431 aa  606  1e-172  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  68.22 
 
 
430 aa  602  1e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  67.21 
 
 
431 aa  603  1e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 
431 aa  601  1e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  66.51 
 
 
429 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  66.28 
 
 
431 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  66.28 
 
 
432 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  65.98 
 
 
437 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  66.13 
 
 
432 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  65.35 
 
 
430 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  65.81 
 
 
432 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 
430 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  66.98 
 
 
429 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 
428 aa  591  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  65.12 
 
 
430 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  65.12 
 
 
432 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  65.12 
 
 
432 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  64.87 
 
 
429 aa  583  1e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  66.04 
 
 
429 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  66.04 
 
 
429 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  63.93 
 
 
429 aa  567  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  63.17 
 
 
429 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  58.31 
 
 
432 aa  493  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  58.31 
 
 
453 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  58.31 
 
 
432 aa  492  1e-138  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  57.85 
 
 
432 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  51.63 
 
 
431 aa  487  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  57.61 
 
 
429 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  57.61 
 
 
429 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
425 aa  480  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  59.02 
 
 
432 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  51.16 
 
 
430 aa  478  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
430 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
433 aa  446  1e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
431 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  51.98 
 
 
432 aa  440  1e-122  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  50.57 
 
 
446 aa  438  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
430 aa  441  1e-122  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  1.14461e-12 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
430 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 
446 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
432 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  49.65 
 
 
432 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.30749e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
442 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.40547e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
427 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
431 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
429 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  52.55 
 
 
436 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
431 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.77348e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  50.69 
 
 
440 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  2.27018e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
432 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.206e-11 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
451 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  50.11 
 
 
435 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  50.78 
 
 
459 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  49.76 
 
 
428 aa  416  1e-115  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  49.77 
 
 
435 aa  415  1e-115  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  51.38 
 
 
447 aa  417  1e-115  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  50.81 
 
 
431 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  51.28 
 
 
437 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  7.37689e-12 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  47.09 
 
 
444 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  50.46 
 
 
446 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
446 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 
444 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  50.92 
 
 
446 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  49.41 
 
 
431 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  51.61 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  51.61 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  47.79 
 
 
447 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 
428 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 
426 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  50.8 
 
 
446 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  51.38 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  51.38 
 
 
448 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  51.15 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0750  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 
431 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.82785e-07  hitchhiker  0.00737735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
430 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 
428 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  47.79 
 
 
447 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 
431 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
428 aa  411  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  51.38 
 
 
448 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>