More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0552 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
269 aa  527  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
271 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  59.53 
 
 
282 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  54.29 
 
 
259 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  56.7 
 
 
275 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
497 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
260 aa  234  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
497 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 
484 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  54.17 
 
 
484 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 
267 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
490 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  54.81 
 
 
271 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.37 
 
 
264 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  48.87 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
269 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
295 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
268 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  48.63 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
494 aa  215  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  48.67 
 
 
492 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
264 aa  214  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  45.45 
 
 
510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
288 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
267 aa  211  9e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 
264 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
268 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
260 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
267 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
283 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  43.92 
 
 
264 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  49.02 
 
 
266 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
264 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 
268 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  40.98 
 
 
269 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
268 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  43.58 
 
 
272 aa  205  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 
262 aa  205  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0818  phosphomethylpyrimidine kinase  51.67 
 
 
272 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0656179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
268 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
264 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
271 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  46 
 
 
271 aa  203  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
266 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
270 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 
270 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.67 
 
 
270 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
284 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
479 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  201  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 
293 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.88 
 
 
271 aa  201  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.59 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  56.65 
 
 
269 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  46.43 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  47.37 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
288 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  46.42 
 
 
288 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
308 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  42.98 
 
 
273 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 
273 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
264 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  47.76 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  47.6 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  46.61 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  44.61 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  48.46 
 
 
268 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  48.79 
 
 
272 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  40.81 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
436 aa  195  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  40.67 
 
 
269 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 
265 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  47.5 
 
 
453 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  48.28 
 
 
266 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  41.7 
 
 
270 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.31 
 
 
266 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>