More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0518 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
343 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.84 
 
 
354 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  52.94 
 
 
348 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.02 
 
 
364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.02 
 
 
364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.88 
 
 
364 aa  331  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.68 
 
 
358 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.39 
 
 
358 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.39 
 
 
358 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.75 
 
 
362 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 
364 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.05 
 
 
363 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 
349 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.87 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.02 
 
 
357 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.3 
 
 
356 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.57 
 
 
364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.99 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.43 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
364 aa  301  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.49 
 
 
359 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
367 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  51.58 
 
 
374 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 
363 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.87 
 
 
364 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.57 
 
 
352 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.16 
 
 
362 aa  299  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.32 
 
 
358 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 
352 aa  295  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.97 
 
 
364 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.62 
 
 
355 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.7 
 
 
356 aa  288  8e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  48.04 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  45.85 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  48.41 
 
 
361 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.4 
 
 
352 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.12 
 
 
348 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.21 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.21 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.09 
 
 
351 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.3 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.09 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 
354 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 
360 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 
357 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.05 
 
 
335 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
361 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 
348 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 
350 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  41.55 
 
 
456 aa  253  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.9 
 
 
360 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.07 
 
 
355 aa  252  6e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  44.16 
 
 
357 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.22 
 
 
347 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.22 
 
 
347 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.01 
 
 
361 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  43.95 
 
 
356 aa  249  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.87 
 
 
359 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.84 
 
 
350 aa  249  5e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  43.44 
 
 
363 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  42.45 
 
 
349 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.86 
 
 
350 aa  247  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.94 
 
 
363 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.67 
 
 
346 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 
365 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 
343 aa  245  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
350 aa  245  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.51 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.23 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.89 
 
 
349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.12 
 
 
344 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.64 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  41 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.25 
 
 
339 aa  242  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 
339 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 
339 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  41.36 
 
 
356 aa  242  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 
344 aa  242  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.34 
 
 
357 aa  242  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.07 
 
 
341 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 
339 aa  242  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2155  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.47 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  44.59 
 
 
375 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
340 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  40.56 
 
 
355 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  43.35 
 
 
371 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.92 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.81 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 
339 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.59 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.11 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.47 
 
 
348 aa  239  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.65 
 
 
339 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.2 
 
 
347 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.88 
 
 
336 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>