More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0507 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 226 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  32.52 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 235 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 266 aa  94.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  35.48 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  39.85 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  34.84 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  34.95 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
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NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 324 aa  71.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  31.48 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  36.29 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.21 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  20.3 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
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